ГОУ Центр образования "Москва-98", был открыт 1 сентября 1999 года на территории Новой Олимпийской деревни, где в 1998 году проживали юные спортсмены из более чем 140 стран - участники Всемирных юношеских игр. В память об этом международном детском спортивном празднике Центру образования было присвоено название "Москва-98". Учредителем ГОУ ЦО "Москва-98" №1953 является Департамент образования города Москвы.